喀什地区第一人民医院
座落于“西域明珠”——新疆喀什古城的新疆喀什地区第一人民医院成立于1934年，是一所集医疗、教学、科研、预防于一体的地州级综合性（二级甲等）医院，医院占地面积7万余平方米，医疗业务用房面积4万余平方米，开放床位500张，在职职工730人，其中卫生技术人员550人，高级职称专家40人，中级职称技术骨干136人。现设临床科室17个，医技科室9个，地区急救中心、眼科中心、血液净化中心、内窥镜中心等设在该院，还设有ICU、CCU重症监护室。改革开发以来，医院不断加强基础设施建设，更新医疗设备。
布尔津县人民医院
新疆布尔津县人民医院位于阿勒泰地区西三县中心位置，始建于1954年，迄今已有55年的建院历史，几十年来，在党和政府的关心、指导下，在各族人民群众的信赖、支持下，医院各项事业得到快速发展，现已发展成为专业设置齐全、技术力量优良、医疗设备先进、服务设施完善，集医疗、教学、急救、预防、保健为一体的综合性二级甲等医院。
新疆维吾尔自治区中医医院
新疆维吾尔自治区中医医院暨新疆医科大学附属中医医院、新疆中医药研究院及新疆中医名医名方研究开发中心，目前是中国西北地区规模最大的综合性三级甲等中医医院。
新疆生产建设兵团第二师库尔勒医院
新疆生产建设兵团第二师库尔勒医院始建于1974年，医院占地面积79664平方米，建筑面积79576平方米，编制床位345张，实际开放516张。是巴州、农二师集医疗、教学、科研、预防保健、急救、康复于一体的国家三级医院、爱婴医院、巴州、农二师医疗保险定点医院，新型农村合作医疗定点医院及医疗商业保险定点医院。
哈密市维吾尔医医院
哈密地区维吾尔医医院是地区唯一一所一级甲等维吾尔医特色综合医院，现为新疆医科大学、自治区维吾尔医专、和田医专、喀什医专、哈密卫校等学校的实习医院。
和田地区人民医院
和田地区人民医院始建于1938年，前身为新疆省立第七医院，1950年改称为和田专区人民医院。历经80余年的建设与发展，目前已成为和田地区唯一一所集医疗、教学、科研、预防、保健、急救为一体的现代化综合性医院。1997年被卫生部命名为“爱婴医院”，先后被评为“全国卫生文明建设先进集体”、“全国民族团结先进集体”、“自治区卫生系统行风先进集体”、“爱婴医院”。医院通过质量管理体系ISO9001认证，连续十年被评为“地区级精神文明单位”。2014年10月和田地区人民医院西院区正式设立。2015年2月我院被自治区卫
霍尔果斯市人民医院
霍尔果斯市人民医院是一所集医疗、教学、急救、科研、预防保健和康复治疗为一体的，环境优美、功能齐全、设备先进、技术优良的综合医院，是新疆维吾尔自治区中医医院医疗技术协作医院、连云港市妇幼保健院友好合作医院、新疆医科大学附属肿瘤医院远程医疗协作单位、伊犁州新华医院医联体成员单位、国家精神心理疾病临床医学研究中心新疆分中心联盟单位、新疆眼耳鼻喉专科联盟单位、伊犁州领军专家郭永忠胃肠包虫病工作室、伊犁丝路职业学院（卫生健康学院分院）定点教学医院。
玛纳斯县人民医院
玛纳斯县人民医院始建于1954年,占地面积4.2万平方米，建筑面积2.8万平方米，经过60多年的奋斗与发展,现已成为集医疗、科研、教学、预防保健、康复和急救于一体的综合性二级甲等医院。也是城镇职工基本医疗保险、商业医疗保险、农牧区合作医疗、城镇居民医疗、劳动伤残鉴定、退休鉴定、大中专招生体检、征兵体检的定点医院,承担着全县7镇4乡2场1站及周边团场26万余人口的医疗救助工作。
新疆军区总医院
新疆军区总医院前身为国民党联勤总部第60医院，新疆和平解放后，1950年1月整编建院。历经10多次编制调整，1986年定编为兰州军区乌鲁木齐总医院。2016年隶属陆军建制，改称新疆军区总医院。医院是一所集医疗、教学、科研、预防、保健为一体的大型综合性三级甲等医院，是新疆维吾尔自治区、新疆生产建设兵团以及乌鲁木齐市医疗保障制度改革定点医疗单位。
新疆生产建设兵团第十师北屯医院
新疆生产建设兵团第十师北屯医院(农十师北屯医院)始建于1959年，位于农十师师部所在地——北屯，是阿勒泰地区六县一市及十师八个农牧团场的交通枢纽，也是国道216线、省道318线、319线的交汇点、奎北铁路的终点站。
喀什市人民医院
喀什市人民医院是一家二级甲等综合医院。医院位于新疆维吾尔自治区喀什地区喀什市健康路5号。
焉耆回族自治县人民医院
焉耆县人民医院始建于1952年12月，是一所集医疗、教学、康复、保健、社区服务为一体的二级甲等综合医院。医院占地总面积37000平方米，建筑面积28600平方米，其中医疗用房14770.47平方米，绿化面积已达65%以上。目前编制床位300张，固定资产5500万元。现有职工464名，其中在编职工291名，聘用职工173名，主任医师职称7名，副主任医师职称29名，中级职称58名，研究生学历4名，大学本科生60名，大学专科生125名。